به دنبال ابلاغي از سوي سيد شهاب‌الدين صدر، رييس سازمان پزشكي قانوني كشور، انديكاسيون‌هاي مادري و جنيني سقط جنين (مواردي كه ادامه بارداري به مرگ جنين يا مرگ مادر منجر مي‌شود) اعلام شد.
 اين سازمان هم‌چنين اعلام كرد: پزشكي قانوني كشور، به منظور ساماندهي موضوع سقط جنين و رفع پاره‌اي از مشكلات موجود، ضابطه‌مند كردن و افزايش دقت صدور مجوز سقط جنين در مراكز پزشكي قانوني، صيانت از مباني شرعي و حفظ حقوق مردم و با در نظر گرفتن ديدگاه‌هاي فقهي، حقوقي و پزشكي موارد مجاز سقط جنين كه با حضور متخصصان رشته‌هاي پزشكي قانوني، جراحي، ارتوپدي، نفرولوژي، ارولوژي، هماتولوژي، اطفال و نوزادان، قلب و عروق، گوارش، ريه، عفوني، روماتولوژي، جراحي اعصاب، پوست، نورولوژي و زنان در كميته‌ي سقط جنين سازمان پزشكي قانوني تعيين و به تصويب رياست محترم قوه قضاييه رسيده، همراه با دستورالعمل نحوه‌ي پذيرش درخواست‌هاي صدور مجوز سقط جنين به كليه رؤساي مراكز پزشكي قانوني سراسر كشور ابلاغ شده است.
مطابق دستورالعمل يادشده، درخواست صدور مجوز سقط درماني تنها در ادارات كل پزشكي قانوني مراكز استان‌ها با دستور مقام قضايي يا درخواست زوجين با معرفي‌نامه پزشك معالج قبل از ولوج روح (چهار ماهگي) مورد پذيرش قرار مي‌گيرد؛ بر اساس اين دستورالعمل معرفي‌نامه پزشك معرف مي‌بايد شامل عكس بيمار، مشخصات شناسنامه‌اي جهت احراز هويت، تشخيص بيماري و روش تشخيصي آن بوده و به پيوست آن تصوير شناسنامه جهت احراز هويت زوجين و نيز نتايج آزمايشات پاراكلينيك ارائه گردد.
همچنين در مورد انديكاسيون‌هاي جنيني انجام حداقل دو نوبت سونوگرافي و در مورد انديكاسيون‌هاي مادري حداقل يك نوبت سونوگرافي براي تعيين سن حاملگي به همراه حداقل دو مشاوره تخصصي در تاييد تشخيص بيماري الزامي است.
بر اساس اين گزارش بررسي در مورد ساير بيماري‌ها در كميته سقط جنين سازمان پزشكي قانوني ادامه داشته و با موارد سقط جنين خارج از ضوابط اعلام شده توسط مراجع ذي‌صلاح برخورد قانوني خواهد شد.
لازم به ذكر است موارد اعلام‌شده شامل بيماري‌هايي است كه در آن ادامه بارداري خطر مرگ مادر را به همراه داشته يا ناهنجاري‌ها و بيماري‌هاي جنيني كه به مرگ جنين داخل رحم (مرده‌زايي) و يا مرگ نوزاد بلافاصله پس از تولد منجر شده و قابل پيشگيري نيز نيست.
انديكاسيون‌هاي سقط جنين در بيماري‌ها و ناهنجاري‌هاي جنيني كه به مرگ جنين داخل رحم (مرده‌زايي) يا مرگ نوزاد بلافاصله بعد از تولد جنين منجر مي‌شوند، عبارتند از:
‌١- استئوژنزيس ايمپرفكتا مادرزادي Osteogenesis imperfecta
‌٢- ديسپلازي استخواني - غضروفي كشنده يا استيپل اپي فيزيال Osteochondrodysplasia
‌٣- بيماري استئوپتروزيس انفانتيل (فرم بدخيم) Osteopetrosis infantile
‌٤- آژنزي دوطرفه كليه Bilateral renal agenesis
‌٥- كليه پلي سيستيك نوع مغلوب Polycystic kidney
‌٦- ديسپلازي مولتي سيستيك كليه‌ها Multicystic dysplatic kidneys
‌٧- سندرم پوتر Potters syndrome
‌٨- سندرم نفروتيك مادرزادي به شرط ايجاد هيدروپس Congenital nephrotic syndrome & Hydrops
‌٩- اختلال كروموزومي كه موجب ضايعات پشرفته و به ويژه گرفتاري مغز و كليه گردد (مانند سندرم واكترل) VACTERL syndrome
‌١٠- هيدرونفروز شديد دوطرفه كليه‌ها Severe bilateral hydronephrosis
‌١١- آلفاتالاسمي (به شكل هيدروپس فتاليس) alpha thalassaemia and fetal hydrops
‌١٢- اختلال ترومبوتيك مثل كمبود پروتئين C (هموزيگوت) و فاكتور ‌٥ ليدن (هموزيگوت) Thrombotic disorders
‌١٣- تريزومي ‌٣ (‌٣، ‌١٨، ‌١٦، ‌١٣، ‌٨، Trisomy)
‌١٤- تريزومي ‌٨
‌١٥- تريزومي ‌١٣
‌١٦- تريزومي ‌١٦
‌١٧- تريزومي ‌١٨
‌١٨- آنانسفالي Anencephaly
‌١٩- هيدروپس فتاليس با هر مكانيسم Foetal hydrops with any etiology
‌٢٠- سندرم فرياد گربه Cats cry syndrome
‌٢١- هولوپرونسفالي Holoprosencephaly
‌٢٢- سيرنگوميليا Syringomyelia
‌٢٣- كرانيوشي سيس Cranioschisis
‌٢٤- مننگوانسفالوسل، مننگوهيدروانسفالوسل Meningoencephalocele/ Meningogydroencephalocele
‌٢٥- ديسپلازي تاناتوفوريك يا كوتولگي كشنده نوزادي Thanatphoric dysplasia
‌٢٦- سيكلوپيا همراه با هولوپروزنسفالي Cyclopia with holoprosencephaly
‌٢٧- ايكتيوزيس مادرزادي lchthyosis congenita neonatorum
‌٢٨- شيزنسفالي Schizencephaly
‌٢٩- اگزانسفالي Exencephalia
انديكاسيون‌هاي سقط جنين در بيماري‌هاي مادر عبارتند از:
‌١- هر بيماري دريچه‌اي كه به نارسايي قلبي منجر به Function class ‌‌٣و ‌٤ رسيده باشد و غيرقابل برگشت به ‌٢ باشد.
‌٢- هر نوع مسائل حاد قلبي غير از كرونر كه به Function class ‌‌٣و ‌٤ رسيده باشد از قبيل ميوكارديت و پريكارديت
‌٣- سابقه بيماري كارديوميوپاتي ديلاته در حاملگي‌هاي قبلي
‌٤- سندرم مارفان در صورتي كه قطر آئورت صعودي بيش از ‌٥ سانتي‌متر باشد
‌٥- سندرم ايزن منگر
‌٦- كبد چرب حاملگي
‌٧- واريس مري Grade III
‌٨- سابقه خونريزي از واريس مري به دنبال افزايش فشار خون پورت Portal Hypertension
‌٩- هپاتيت اتوايمون غيرقابل كنترل
‌١٠- نارسايي كليه
‌١١- فشار خون غيرقابل كنترل با داورهاي مجاز در دوران حاملگي
‌١٢- هر بيماري ريوي اعم از آمفيزم، فيبروز، كايفواسكوليوز kyphoscoliosis و برونشكتازي منتشر Diffuse bronchiectasis به شرط ايجاد افزايش خون ريوي Pulmonary Hypertention حتي از نوع خفيف Mild
‌١٣- توانايي انعقادي افزون‌يافته Hypercoagulability كه تجويز هپارين منجر به تشديد بيماري ديگري گردد كه جان مادر را تهديد مي‌كند.
‌١٤- ابتلا به ويروس HIV كه وارد مرحله بيماري AIDS شده باشد.
‌١٥- لوپوس فعال غيرقابل كنترل با درگيري يك ارگان ماژور
‌١٦- واسكوليت‌ها زماني كه ارگان‌هاي ماژور درگير باشند.
‌١٧- تمامي توده‌هاي فضاگير CNS با توجه به نوع و محل آن كه شروع درمان در جنين و عدم شروع درمان در مادر باعث خطر جاني گردد.
‌١٨- پمفيگوس ولگاريس، پسوريازيس شديد و ژنراليزه و ملانوم نوع پيشرفته كه باعث خطر جدي جاني براي مادر شود.
‌٩١- موارد اپي‌لپسي كه عليرغم درمان چند دارويي مقاوم به درمان باشد.
‌٢٠- موارد MS) Multiple Sclerosis) كه باعث ناتواني بيمار Disability شده باشد.
‌٢١- مياستني گراو در مراحل پيشرفته به شرط اينكه خطر جدي جاني براي مادر داشته باشد.
‌٢٢- انواعي از بيماري‌هاي موتورنورون Motor neuron مثل ALS كه با حاملگي تشديد يافته و براي مادر خطر جدي جاني داشته باشد.